Часто причиной низкой всхожести семян становится длительное, более 12 часов, замачивание семян в воде или растворах. Дефицит кислорода внутри семени при этом вызывает гибель зародыша.
Ёмкости для посева без дренажных отверстий или с недостаточным их размером могут привести к избыточному увлажнению почвы, недостатку кислорода и гниению семян.